В описаниях исследователя Крашенниникова и на старых картах остров пренебрежительно назывался Худой Шантар.

В описаниях исследователя Крашенниникова и на старых картах остров пренебрежительно назывался Худой Шантар. Поминаемые гиляки – устаревшее название нивхов, живших в то время и по берегам Охотского моря. Справедливости ради, их вина вовсе не так очевидна: Малый Шантар страдал от огня неоднократно, в том числе из-за деятельности многочисленных китобоев и промысловых компаний. Сегодня следов от ужасных пожаров почти не осталось, природа постаралась восстановить свои потери

В центре острова почти вдоль меридиана проходит хребет Малый, названный так хабаровским ботаником А.П. Нечаевым. По сути, он является продолжением материкового горного хребта, и сложен из тех же горных пород. Высшая точка острова высотой 224 м расположена на севере. Его южная оконечность веерообразно разделяется на две части. Каждая часть когда-то была отдельным островом, но впоследствии они соединились поднявшимися из моря низкими болотистыми перешейками: по мнению геологов это подтверждение того, что формирование архипелага продолжается и по сей день.

Берега острова в большинстве своём обрывистые. Сильные местные течения здорово поработали над береговой линией: она здесь сильно изрезанная, много красивых мысов и кекуров, от которых отходят небольшие рифы. Самые известные из них: мыс Успения на севере, мыс Гайковского на юго-востоке, мыс Юго-западный и Северо-Восточный, а также Соленый и Горбатый в западной части. Между мысами в берег вдается достаточно много мелких уютных бухточек с галечными пляжами. Все они были бы идеальным местом для стоянки, если бы не отсутствие в некоторых из них пресной воды. Наиболее известные и удобные бухты, где часто останавливаются путешественники – Лагерная и Абрек

Осенние штормовые волны выносят на берег груды плавника, который скапливается на верхнем урезе косы. Выбеленные останки деревьев переплетаются самым живописным образом, напоминая сложную деревянную скульптуру. Почти весь Малый Шантар покрыт лесами, чаще всего лиственничными. Вдоль западной стороны острова многие деревья полегли, их стволы прижаты к земле, а кроны вытянулись в одном направлении, как флаги

Наиболее известен ключ Абрек, впадающий в одноименную бухту. На юге острова, на заболоченной низменности в районе перешейка, раскинулась большая марь, на которой разместилось более десятка крупных озер. Это настоящий болотный рай для водоплавающих пернатых: здесь постоянно живут лебединые пары, утки, гуси, цапли и кулики. Как во многих болотистых местах, в окрестностях просто невероятное количество морошки – буквально «желтые ковры»

На Малом Шантаре, в отличие от многих других островов архипелага, нет больших птичьих базаров: расплодившиеся медведи и лисы следят за ростом популяции пернатых. Зато много орланов, которые облюбовали местные кекуры и неприступные скалы – они живут рыбной ловлей и предпочитают селиться у береговой линии. Такое многообразие тем более удивительно, если учесть, что до революции природа Малого Шантара сильно пострадала от пожаров и хищнического браконьерства. Леса островов были полностью уничтожены, а зверь выбит. В настоящее время природа всех островов восстанавливается.

Бухта Абрек, находится в юго-восточной части острова Малый Шантар, между мысами Энегельма и Гайковского, и названа в честь клипера «Абрек», экипаж которого обследовал и картографировал бухту во время экспедиции 1855 года. Бухта очень красива, укрыта от северных ветров и удобна для корабельной стоянки и высадки на берег. При южных, юго-восточных и восточных ветрах в ней также не бывает сильного волнения. По этим причинам (а также из-за огромного количества китов в здешних водах) она активно использовалась китобоями и в 19 веке считалась центром китобойного промысла.

В бухте и ее окрестностях шикарная марь и много морошки: в особо урожайные годы вся земля будто желтым ковром покрыта огромным количеством ягод. Самая южная точка острова Малый Шантар. Мыс назван по фамилии поручика Корпуса флотских штурманов Михаила Ивановича Гайковского, в 1885 году на клипере «Абрек» участвовавшего в исследовательской экспедиции на Шантарские острова. Мыс Гайковского является оконечностью узкого возвышенного полуострова, выдающегося на юго-восток от южной части Малого Шантара.

Часть наблюдений – например, контроль облаков, состояние снежного и ледяного покрова в Шантарском море – автоматике не доверишь, так что этим по-прежнему занимаются живые люди. На метеостанции живут всего 2 человека, муж и жена, Валера и Марина Путовы. С приходом цивилизации на метео появился более менее сносный спутниковый интернет, Валера периодически выходит на связь рассказывая новости со своего острова. Девять месяцев в году Шантары объяты льдом. А сотрудники метеостанции не выезжают в отпуск по 2-3 года. Люди на Большом Шантаре появляются только в конце июля. Приезжают туристы и сотрудники национального парка, а уже в сентябре все уезжают, и снова наступает долгая зима. Время там течёт медленно, а пространство сжимается до стен метеостанции